Code source wiki de Les Noms scientifiques
Modifié par Joséphine Ducruet le 2025/10/29 17:17
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| author | version | line-number | content |
|---|---|---|---|
| 1 | (% class="mark small" %)**Versions 3.5 et ultérieures** | ||
| 2 | |||
| 3 | |(% style="width:840px" %)((( | ||
| 4 | (% class="box" %) | ||
| 5 | ((( | ||
| 6 | Les autorités **Noms scientifiques** permettent de centraliser et structurer les désignations taxonomiques associées aux collections : espèces animales ou végétales, fossiles, minéraux, etc. Elles servent à identifier de manière rigoureuse les spécimens, objets naturalistes ou éléments représentés dans les œuvres, en s’appuyant sur des référentiels scientifiques reconnus. | ||
| 7 | |||
| 8 | Gérées sous forme de **thésaurus hiérarchique**, elles permettent de refléter la classification systématique, d’optimiser les recherches et d’éviter les doublons ou incohérences terminologiques. | ||
| 9 | ))) | ||
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| 11 | ((( | ||
| 12 | = À quoi servent les autorités Noms scientifiques ? = | ||
| 13 | |||
| 14 | Elles permettent de documenter tous les noms scientifiques liés aux collections, qu’il s’agisse : | ||
| 15 | |||
| 16 | * **d’espèces animales** (//Canis lupus//, //Panthera leo//…), | ||
| 17 | * des** plantes ou **des** champignons** (//Quercus robur//, //Amanita muscaria//…), | ||
| 18 | * des** fossiles** (//Trilobita//, Ammonites…), | ||
| 19 | * des **taxons supérieurs** (familles, genres, ordres : //Rosaceae//, //Coleoptera//, //Mammalia//…), | ||
| 20 | * des** minéraux **(quartz, pyrite, malachite...), | ||
| 21 | * ou des **organismes vivants ou disparus** identifiés selon les règles de la nomenclature biologique. | ||
| 22 | |||
| 23 | Ces autorités peuvent être mobilisées dans différents contextes : | ||
| 24 | |||
| 25 | * **Descriptif **ou **classificatoire** : identification d’un spécimen, d’un objet naturaliste, ou d’un motif figuré. | ||
| 26 | * **Collecte **ou** provenance** : détermination d’un taxon pour un échantillon collecté. | ||
| 27 | * **Représentatif** : présence d’un nom d’espèce dans une image, un film, un texte, etc. | ||
| 28 | * **Culturel ou symbolique** : référence à un organisme dans une œuvre à caractère ethnographique ou religieux. | ||
| 29 | |||
| 30 | >(% class="small" %)Exemples d’usage : | ||
| 31 | >(% class="small" %)Un papillon naturalisé identifié comme //Papilio machaon// : lié à l’autorité //Papilio machaon// | ||
| 32 | >(% class="small" %)Un herbier contenant une fougère : lié à //Pteridium aquilinum// | ||
| 33 | >(% class="small" %)Une fresque antique représentant un lion : liée à //Panthera leo// | ||
| 34 | >(% class="small" %)Une fouille paléontologique ayant livré un fossile : lié à //Ichthyosaurus communis// | ||
| 35 | >(% class="small" %)Une notice de photographie illustrant une coccinelle : liée à //Coccinella septempunctata// | ||
| 36 | >(% class="small" %)Un film ethnographique montrant la préparation d’un remède à base d'armoise annuelle : lié à //Artemisia annua// | ||
| 37 | |||
| 38 | Les noms scientifiques sont structurés dans un **thésaurus hiérarchique**, reflétant la classification taxonomique : Règne > Phylum > Classe > Ordre > Famille > Genre > Espèce. | ||
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| 40 | Cela permet de : | ||
| 41 | ))) | ||
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| 43 | ((( | ||
| 44 | * **Rechercher un ensemble de notices via le taxon supérieur (**//ex. Felidae //→ //Panthera leo//, //Felis catus//…), | ||
| 45 | * **Gérer les synonymes** taxonomiques (ex. //Brontosaurus// redirigé vers //Apatosaurus),// | ||
| 46 | * **Préserver la cohérence scientifique** : noms validés et normalisés | ||
| 47 | * **Éviter les doublons** et les erreurs de typographie (//Homo Sapiens// ≠ //Homo sapiens//) | ||
| 48 | |||
| 49 | = Comment créer un nouveau Nom scientifique ? = | ||
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| 51 | (% class="box successmessage" %) | ||
| 52 | ((( | ||
| 53 | **Bonnes pratiques** | ||
| 54 | |||
| 55 | * Inclure le **descripteur** (ex. //Panthera leo// Linnaeus, 1758) si connu. | ||
| 56 | * **Vérifier l'existence** du terme avant création pour éviter les doublons. | ||
| 57 | * **Positionner correctement** le terme dans l’arborescence (famille, genre, espèce, etc.). | ||
| 58 | * **N’utiliser que la forme latine** ; les noms vernaculaires sont exclus. | ||
| 59 | ))) | ||
| 60 | |||
| 61 | == Ajouter un nouveau terme == | ||
| 62 | |||
| 63 | 1. Ouvrir le module **Autorités** > **Noms scientifiques**. | ||
| 64 | 1. Activer la **vue arborescente**. | ||
| 65 | 1. Se positionner sur le niveau hiérarchique souhaité ou à la racine si nécessaire | ||
| 66 | 1. Cliquer sur **« Ajouter un terme »**. | ||
| 67 | 1. Saisir le **nom scientifique**. | ||
| 68 | 1. Valider : le terme est ajouté à l’arborescence. Le terme ainsi ajouté n’est pas encore documenté. | ||
| 69 | |||
| 70 | [[Ajout d'un terme dans le thésaurus>>image:1751891366231-683.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
| 71 | |||
| 72 | |||
| 73 | [[Saisie du terme>>image:1751891554646-463.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
| 74 | |||
| 75 | [[Terme ajouté dans l'arborescence>>image:1751891596047-185.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
| 76 | |||
| 77 | == Documenter la notice == | ||
| 78 | |||
| 79 | 1. Cliquer sur l’icône **crayon** de la notice (pas celui du thésaurus). | ||
| 80 | 1. Sélectionner une **grille de saisie** adaptée. | ||
| 81 | 1. Renseigner les **champs disponibles** (descripteur, source, date, remarques…). | ||
| 82 | 1. Enregistrer la notice. | ||
| 83 | |||
| 84 | [[Exemple de champs disponibles>>image:1751891945732-416.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
| 85 | |||
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| 87 | = Focus = | ||
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| 89 | == Aligner un Nom scientifique avec ITIS == | ||
| 90 | |||
| 91 | (% class="mark small" %)**Versions 4.5.21 et ultérieures** | ||
| 92 | ))) | ||
| 93 | |||
| 94 | ((( | ||
| 95 | Flora permet d’aligner une autorité avec la base externe de référence **[[ITIS>>https://itis.gov/||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]] (Integrated Taxonomic Information System)**. | ||
| 96 | |||
| 97 | (% class="box warningmessage" %) | ||
| 98 | ((( | ||
| 99 | Cette fonctionnalité nécessite un **paramétrage spécifique **de votre instance Flora (option) | ||
| 100 | ))) | ||
| 101 | |||
| 102 | 1. Ouvrir la **notice du nom scientifique** concerné. | ||
| 103 | 1. Cliquer sur l’icône **d’alignement externe**. | ||
| 104 | 1. Choisir la source : **ITIS**. | ||
| 105 | 1. Saisir l’**identifiant ITIS** du taxon. | ||
| 106 | 1. Cliquer sur **Aligner** | ||
| 107 | |||
| 108 | [[Aligner un nom scientifique>>image:1751892791778-582.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
| 109 | |||
| 110 | |||
| 111 | [[Renseigner la source et l'identifiant du taxon>>image:1751892931804-833.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
| 112 | |||
| 113 | |||
| 114 | Une fois l’alignement effectué : | ||
| 115 | |||
| 116 | * Le lien vers ITIS est automatiquement ajouté dans la notice, dans la partie inférieure, | ||
| 117 | * Il est également visible dans les notices de biens liés à ce taxon. | ||
| 118 | |||
| 119 | [[Exemple d'une notice d'un nom scientifique aligné avec ITIS>>image:1751893060250-711.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
| 120 | |||
| 121 | |||
| 122 | [[Exemple d'une notice bien dont le nom scientifique est aligné avec ITIS>>image:1751893153980-688.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
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| 126 | ))) | ||
| 127 | )))|(% style="width:300px" %)((( | ||
| 128 | (% class="box" %) | ||
| 129 | ((( | ||
| 130 | **Sommaire** | ||
| 131 | |||
| 132 | {{toc depth="2" numbered="true"/}} | ||
| 133 | ))) | ||
| 134 | |||
| 135 | (% class="box" %) | ||
| 136 | ((( | ||
| 137 | **Aller plus loin** | ||
| 138 | |||
| 139 | * [[Référentiel des champs>>doc:.Référentiel des champs - Noms scientifiques.WebHome||target="_blank"]] | ||
| 140 | |||
| 141 | * [[Saisir une autorité>>url:http://46.105.158.203/xwiki/bin/view/1_Fonctionnalit%C3%A9s/5.C.%20Saisie/Saisir%20une%20autorit%C3%A9/||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]] | ||
| 142 | * [[Comprendre les types de champs et leur contrôle>>url:http://46.105.158.203/xwiki/bin/view/1_Fonctionnalit%C3%A9s/5.C.%20Saisie/Les%20diff%C3%A9rents%20types%20de%20champs/||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]] | ||
| 143 | * [[Utiliser et administrer les thésaurus dans Flora>>url:http://46.105.158.203/xwiki/bin/view/1_Fonctionnalit%C3%A9s/5.C.%20Saisie/5.E.%20Thesaurus/||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]] | ||
| 144 | ))) | ||
| 145 | |||
| 146 | (% class="box" %) | ||
| 147 | ((( | ||
| 148 | **Icônes principales** | ||
| 149 | |||
| 150 | * [[image:1751381864410-542.png]] : Ajouter un terme | ||
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| 152 | * [[image:1751554433028-352.png]] : Modifier | ||
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| 154 | * [[image:1751893659749-575.png||height="21" width="18"]] : Aligner avec ITIS | ||
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