Code source wiki de Les Noms scientifiques

Modifié par Joséphine Ducruet le 2025/10/29 17:17

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1 (% class="mark small" %)**Versions 3.5 et ultérieures**
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3 |(% style="width:840px" %)(((
4 (% class="box" %)
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6 Les autorités **Noms scientifiques** permettent de centraliser et structurer les désignations taxonomiques associées aux collections : espèces animales ou végétales, fossiles, minéraux, etc. Elles servent à identifier de manière rigoureuse les spécimens, objets naturalistes ou éléments représentés dans les œuvres, en s’appuyant sur des référentiels scientifiques reconnus.
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8 Gérées sous forme de **thésaurus hiérarchique**, elles permettent de refléter la classification systématique, d’optimiser les recherches et d’éviter les doublons ou incohérences terminologiques.
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12 = À quoi servent les autorités Noms scientifiques ? =
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14 Elles permettent de documenter tous les noms scientifiques liés aux collections, qu’il s’agisse :
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16 * **d’espèces animales** (//Canis lupus//, //Panthera leo//…),
17 * des** plantes ou **des** champignons** (//Quercus robur//, //Amanita muscaria//…),
18 * des** fossiles** (//Trilobita//, Ammonites…),
19 * des **taxons supérieurs** (familles, genres, ordres : //Rosaceae//, //Coleoptera//, //Mammalia//…),
20 * des** minéraux **(quartz, pyrite, malachite...),
21 * ou des **organismes vivants ou disparus** identifiés selon les règles de la nomenclature biologique.
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23 Ces autorités peuvent être mobilisées dans différents contextes :
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25 * **Descriptif **ou **classificatoire** : identification d’un spécimen, d’un objet naturaliste, ou d’un motif figuré.
26 * **Collecte **ou** provenance** : détermination d’un taxon pour un échantillon collecté.
27 * **Représentatif** : présence d’un nom d’espèce dans une image, un film, un texte, etc.
28 * **Culturel ou symbolique** : référence à un organisme dans une œuvre à caractère ethnographique ou religieux.
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30 >(% class="small" %)Exemples d’usage :
31 >(% class="small" %)Un papillon naturalisé identifié comme //Papilio machaon// : lié à l’autorité //Papilio machaon//
32 >(% class="small" %)Un herbier contenant une fougère : lié à //Pteridium aquilinum//
33 >(% class="small" %)Une fresque antique représentant un lion : liée à //Panthera leo//
34 >(% class="small" %)Une fouille paléontologique ayant livré un fossile : lié à //Ichthyosaurus communis//
35 >(% class="small" %)Une notice de photographie illustrant une coccinelle : liée à //Coccinella septempunctata//
36 >(% class="small" %)Un film ethnographique montrant la préparation d’un remède à base d'armoise annuelle : lié à //Artemisia annua//
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38 Les noms scientifiques sont structurés dans un **thésaurus hiérarchique**, reflétant la classification taxonomique : Règne > Phylum > Classe > Ordre > Famille > Genre > Espèce.
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40 Cela permet de :
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44 * **Rechercher un ensemble de notices via le taxon supérieur (**//ex. Felidae //→ //Panthera leo//, //Felis catus//…),
45 * **Gérer les synonymes** taxonomiques (ex. //Brontosaurus// redirigé vers //Apatosaurus),//
46 * **Préserver la cohérence scientifique** : noms validés et normalisés
47 * **Éviter les doublons** et les erreurs de typographie (//Homo Sapiens// ≠ //Homo sapiens//)
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49 = Comment créer un nouveau Nom scientifique ? =
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51 (% class="box successmessage" %)
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53 **Bonnes pratiques**
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55 * Inclure le **descripteur** (ex. //Panthera leo// Linnaeus, 1758) si connu.
56 * **Vérifier l'existence** du terme avant création pour éviter les doublons.
57 * **Positionner correctement** le terme dans l’arborescence (famille, genre, espèce, etc.).
58 * **N’utiliser que la forme latine** ; les noms vernaculaires sont exclus.
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61 == Ajouter un nouveau terme ==
62
63 1. Ouvrir le module **Autorités** > **Noms scientifiques**.
64 1. Activer la **vue arborescente**.
65 1. Se positionner sur le niveau hiérarchique souhaité ou à la racine si nécessaire
66 1. Cliquer sur **« Ajouter un terme »**.
67 1. Saisir le **nom scientifique**.
68 1. Valider : le terme est ajouté à l’arborescence. Le terme ainsi ajouté n’est pas encore documenté.
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70 [[Ajout d'un terme dans le thésaurus>>image:1751891366231-683.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
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73 [[Saisie du terme>>image:1751891554646-463.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
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75 [[Terme ajouté dans l'arborescence>>image:1751891596047-185.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
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77 == Documenter la notice ==
78
79 1. Cliquer sur l’icône **crayon** de la notice (pas celui du thésaurus).
80 1. Sélectionner une **grille de saisie** adaptée.
81 1. Renseigner les **champs disponibles** (descripteur, source, date, remarques…).
82 1. Enregistrer la notice.
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84 [[Exemple de champs disponibles>>image:1751891945732-416.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
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87 = Focus =
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89 == Aligner un Nom scientifique avec ITIS ==
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91 (% class="mark small" %)**Versions 4.5.21 et ultérieures**
92 )))
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94 (((
95 Flora permet d’aligner une autorité avec la base externe de référence **[[ITIS>>https://itis.gov/||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]] (Integrated Taxonomic Information System)**.
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97 (% class="box warningmessage" %)
98 (((
99 Cette fonctionnalité nécessite un **paramétrage spécifique **de votre instance Flora (option)
100 )))
101
102 1. Ouvrir la **notice du nom scientifique** concerné.
103 1. Cliquer sur l’icône **d’alignement externe**.
104 1. Choisir la source : **ITIS**.
105 1. Saisir l’**identifiant ITIS** du taxon.
106 1. Cliquer sur **Aligner**
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108 [[Aligner un nom scientifique>>image:1751892791778-582.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
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111 [[Renseigner la source et l'identifiant du taxon>>image:1751892931804-833.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
112
113
114 Une fois l’alignement effectué :
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116 * Le lien vers ITIS est automatiquement ajouté dans la notice, dans la partie inférieure,
117 * Il est également visible dans les notices de biens liés à ce taxon.
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119 [[Exemple d'une notice d'un nom scientifique aligné avec ITIS>>image:1751893060250-711.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
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122 [[Exemple d'une notice bien dont le nom scientifique est aligné avec ITIS>>image:1751893153980-688.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
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127 )))|(% style="width:300px" %)(((
128 (% class="box" %)
129 (((
130 **Sommaire**
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132 {{toc depth="2" numbered="true"/}}
133 )))
134
135 (% class="box" %)
136 (((
137 **Aller plus loin**
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139 * [[Référentiel des champs>>doc:.Référentiel des champs - Noms scientifiques.WebHome||target="_blank"]]
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141 * [[Saisir une autorité>>url:http://46.105.158.203/xwiki/bin/view/1_Fonctionnalit%C3%A9s/5.C.%20Saisie/Saisir%20une%20autorit%C3%A9/||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]]
142 * [[Comprendre les types de champs et leur contrôle>>url:http://46.105.158.203/xwiki/bin/view/1_Fonctionnalit%C3%A9s/5.C.%20Saisie/Les%20diff%C3%A9rents%20types%20de%20champs/||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]]
143 * [[Utiliser et administrer les thésaurus dans Flora>>url:http://46.105.158.203/xwiki/bin/view/1_Fonctionnalit%C3%A9s/5.C.%20Saisie/5.E.%20Thesaurus/||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]]
144 )))
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146 (% class="box" %)
147 (((
148 **Icônes principales**
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150 * [[image:1751381864410-542.png]] : Ajouter un terme
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152 * [[image:1751554433028-352.png]] : Modifier
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154 * [[image:1751893659749-575.png||height="21" width="18"]] : Aligner avec ITIS
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