Code source wiki de Les Noms scientifiques

Modifié par Joséphine Ducruet le 2025/10/29 17:17

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Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 15.1 1 (% class="mark small" %)**Versions 3.5 et ultérieures**
Joséphine Ducruet 3.1 2
3 |(% style="width:840px" %)(((
Joséphine Ducruet 10.1 4 (% class="box" %)
Joséphine Ducruet 4.1 5 (((
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 6 Les autorités **Noms scientifiques** permettent de centraliser et structurer les désignations taxonomiques associées aux collections : espèces animales ou végétales, fossiles, minéraux, etc. Elles servent à identifier de manière rigoureuse les spécimens, objets naturalistes ou éléments représentés dans les œuvres, en s’appuyant sur des référentiels scientifiques reconnus.
Joséphine Ducruet 10.1 7
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 8 Gérées sous forme de **thésaurus hiérarchique**, elles permettent de refléter la classification systématique, d’optimiser les recherches et d’éviter les doublons ou incohérences terminologiques.
Joséphine Ducruet 10.1 9 )))
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11 (((
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 12 = À quoi servent les autorités Noms scientifiques ? =
Joséphine Ducruet 3.1 13
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 14 Elles permettent de documenter tous les noms scientifiques liés aux collections, qu’il s’agisse :
Joséphine Ducruet 3.1 15
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 16 * **d’espèces animales** (//Canis lupus//, //Panthera leo//…),
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 13.1 17 * des** plantes ou **des** champignons** (//Quercus robur//, //Amanita muscaria//…),
Joséphine Ducruet 22.1 18 * des** fossiles** (//Trilobita//, Ammonites…),
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 19 * des **taxons supérieurs** (familles, genres, ordres : //Rosaceae//, //Coleoptera//, //Mammalia//…),
Joséphine Ducruet 22.1 20 * des** minéraux **(quartz, pyrite, malachite...),
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 21 * ou des **organismes vivants ou disparus** identifiés selon les règles de la nomenclature biologique.
Joséphine Ducruet 3.1 22
Joséphine Ducruet 23.1 23 Ces autorités peuvent être mobilisées dans différents contextes :
Joséphine Ducruet 3.1 24
Joséphine Ducruet 23.1 25 * **Descriptif **ou **classificatoire** : identification d’un spécimen, d’un objet naturaliste, ou d’un motif figuré.
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 13.1 26 * **Collecte **ou** provenance** : détermination d’un taxon pour un échantillon collecté.
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 27 * **Représentatif** : présence d’un nom d’espèce dans une image, un film, un texte, etc.
28 * **Culturel ou symbolique** : référence à un organisme dans une œuvre à caractère ethnographique ou religieux.
Joséphine Ducruet 3.1 29
30 >(% class="small" %)Exemples d’usage :
Joséphine Ducruet 10.1 31 >(% class="small" %)Un papillon naturalisé identifié comme //Papilio machaon// : lié à l’autorité //Papilio machaon//
Joséphine Ducruet 3.1 32 >(% class="small" %)Un herbier contenant une fougère : lié à //Pteridium aquilinum//
33 >(% class="small" %)Une fresque antique représentant un lion : liée à //Panthera leo//
34 >(% class="small" %)Une fouille paléontologique ayant livré un fossile : lié à //Ichthyosaurus communis//
35 >(% class="small" %)Une notice de photographie illustrant une coccinelle : liée à //Coccinella septempunctata//
36 >(% class="small" %)Un film ethnographique montrant la préparation d’un remède à base d'armoise annuelle : lié à //Artemisia annua//
Joséphine Ducruet 4.1 37
Joséphine Ducruet 20.1 38 Les noms scientifiques sont structurés dans un **thésaurus hiérarchique**, reflétant la classification taxonomique : Règne > Phylum > Classe > Ordre > Famille > Genre > Espèce.
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 39
40 Cela permet de :
Joséphine Ducruet 4.1 41 )))
42
43 (((
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 44 * **Rechercher un ensemble de notices via le taxon supérieur (**//ex. Felidae //→ //Panthera leo//, //Felis catus//…),
45 * **Gérer les synonymes** taxonomiques (ex. //Brontosaurus// redirigé vers //Apatosaurus),//
Joséphine Ducruet 4.1 46 * **Préserver la cohérence scientifique** : noms validés et normalisés
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 47 * **Éviter les doublons** et les erreurs de typographie (//Homo Sapiens// ≠ //Homo sapiens//)
Joséphine Ducruet 4.1 48
Joséphine Ducruet 5.1 49 = Comment créer un nouveau Nom scientifique ? =
Joséphine Ducruet 4.1 50
51 (% class="box successmessage" %)
52 (((
53 **Bonnes pratiques**
54
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 55 * Inclure le **descripteur** (ex. //Panthera leo// Linnaeus, 1758) si connu.
56 * **Vérifier l'existence** du terme avant création pour éviter les doublons.
57 * **Positionner correctement** le terme dans l’arborescence (famille, genre, espèce, etc.).
58 * **N’utiliser que la forme latine** ; les noms vernaculaires sont exclus.
Joséphine Ducruet 4.1 59 )))
60
Joséphine Ducruet 5.1 61 == Ajouter un nouveau terme ==
Joséphine Ducruet 4.1 62
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 63 1. Ouvrir le module **Autorités** > **Noms scientifiques**.
64 1. Activer la **vue arborescente**.
65 1. Se positionner sur le niveau hiérarchique souhaité ou à la racine si nécessaire
66 1. Cliquer sur **« Ajouter un terme »**.
67 1. Saisir le **nom scientifique**.
68 1. Valider : le terme est ajouté à l’arborescence. Le terme ainsi ajouté n’est pas encore documenté.
Joséphine Ducruet 4.1 69
70 [[Ajout d'un terme dans le thésaurus>>image:1751891366231-683.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
71
72
Joséphine Ducruet 5.1 73 [[Saisie du terme>>image:1751891554646-463.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
74
75 [[Terme ajouté dans l'arborescence>>image:1751891596047-185.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
76
Joséphine Ducruet 6.1 77 == Documenter la notice ==
Joséphine Ducruet 5.1 78
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 79 1. Cliquer sur l’icône **crayon** de la notice (pas celui du thésaurus).
80 1. Sélectionner une **grille de saisie** adaptée.
81 1. Renseigner les **champs disponibles** (descripteur, source, date, remarques…).
82 1. Enregistrer la notice.
Joséphine Ducruet 5.1 83
84 [[Exemple de champs disponibles>>image:1751891945732-416.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
85
86
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 87 = Focus =
Joséphine Ducruet 5.1 88
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 89 == Aligner un Nom scientifique avec ITIS ==
Joséphine Ducruet 6.1 90
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 15.1 91 (% class="mark small" %)**Versions 4.5.21 et ultérieures**
Joséphine Ducruet 6.1 92 )))
93
Joséphine Ducruet 7.1 94 (((
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 13.1 95 Flora permet d’aligner une autorité avec la base externe de référence **[[ITIS>>https://itis.gov/||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]] (Integrated Taxonomic Information System)**.
Joséphine Ducruet 7.1 96
97 (% class="box warningmessage" %)
98 (((
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 99 Cette fonctionnalité nécessite un **paramétrage spécifique **de votre instance Flora (option)
Joséphine Ducruet 7.1 100 )))
101
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 102 1. Ouvrir la **notice du nom scientifique** concerné.
103 1. Cliquer sur l’icône **d’alignement externe**.
104 1. Choisir la source : **ITIS**.
105 1. Saisir l’**identifiant ITIS** du taxon.
106 1. Cliquer sur **Aligner**
Joséphine Ducruet 7.1 107
108 [[Aligner un nom scientifique>>image:1751892791778-582.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
109
110
111 [[Renseigner la source et l'identifiant du taxon>>image:1751892931804-833.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
112
113
114 Une fois l’alignement effectué :
115
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 116 * Le lien vers ITIS est automatiquement ajouté dans la notice, dans la partie inférieure,
117 * Il est également visible dans les notices de biens liés à ce taxon.
Joséphine Ducruet 7.1 118
119 [[Exemple d'une notice d'un nom scientifique aligné avec ITIS>>image:1751893060250-711.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
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122 [[Exemple d'une notice bien dont le nom scientifique est aligné avec ITIS>>image:1751893153980-688.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
123
Joséphine Ducruet 10.1 124
Joséphine Ducruet 5.1 125
Joséphine Ducruet 7.1 126 )))
Joséphine Ducruet 8.1 127 )))|(% style="width:300px" %)(((
128 (% class="box" %)
Joséphine Ducruet 7.1 129 (((
130 **Sommaire**
Joséphine Ducruet 3.1 131
Joséphine Ducruet 7.1 132 {{toc depth="2" numbered="true"/}}
133 )))
134
Joséphine Ducruet 8.1 135 (% class="box" %)
136 (((
137 **Aller plus loin**
138
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 14.1 139 * [[Référentiel des champs>>doc:.Référentiel des champs - Noms scientifiques.WebHome||target="_blank"]]
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 12.1 140
Doriane Bautista 17.1 141 * [[Saisir une autorité>>url:http://46.105.158.203/xwiki/bin/view/1_Fonctionnalit%C3%A9s/5.C.%20Saisie/Saisir%20une%20autorit%C3%A9/||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]]
142 * [[Comprendre les types de champs et leur contrôle>>url:http://46.105.158.203/xwiki/bin/view/1_Fonctionnalit%C3%A9s/5.C.%20Saisie/Les%20diff%C3%A9rents%20types%20de%20champs/||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]]
143 * [[Utiliser et administrer les thésaurus dans Flora>>url:http://46.105.158.203/xwiki/bin/view/1_Fonctionnalit%C3%A9s/5.C.%20Saisie/5.E.%20Thesaurus/||rel="noopener noreferrer" target="_blank"]]
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146 (% class="box" %)
147 (((
148 **Icônes principales**
149
150 * [[image:1751381864410-542.png]] : Ajouter un terme
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 13.1 151
Joséphine Ducruet 8.1 152 * [[image:1751554433028-352.png]] : Modifier
Pascale STEIMETZ-LE CACHEUX 13.1 153
Joséphine Ducruet 8.1 154 * [[image:1751893659749-575.png||height="21" width="18"]] : Aligner avec ITIS
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