Les autorités Noms scientifiques

Version 7.1 par Joséphine Ducruet le 2025/07/07 15:02

Versions 3.5 et ultérieurs

A quoi servent les autorités Noms scientifiques ?

Documenter de manière centralisée et normalisée tous les noms scientifiques associés aux collections, qu’il s’agisse :

  • de noms d’espèces animales (Canis lupus, Panthera leo…),
  • de noms de plantes ou champignons (Quercus robur, Amanita muscaria…),
  • de noms fossiles ou périodes paléontologiques (Trilobita, Diplodocus, Jurassique supérieur…),
  • ou de taxons supérieurs (familles, genres, ordres : Rosaceae, Coleoptera, Mammalia…).
  • ou de tout organisme vivant ou disparu identifié selon les règles de la nomenclature biologique.

Les autorités Noms scientifiques concernent tout être vivant ou entité biologique ayant un lien direct ou indirect avec les collections, que ce lien soit :

  • Descriptif ou classificatoire : désignation d’un spécimen, d’un objet naturaliste ou d’un motif figuré (ex. : un insecte représenté dans une œuvre).
  • Collecte ou provenance : taxon déterminé d’un échantillon collecté sur le terrain.
  • Représentatif : nom d’espèce mentionné ou identifié dans un texte, une image, un film, un audio…
  • Culturel ou symbolique : référence à un animal ou une plante dans une œuvre à valeur ethnographique ou religieuse.

 Dès qu’une identification scientifique est possible, ou qu’un taxon est nommé, représenté ou étudié, une autorité "Nom scientifique" peut (et doit) être utilisée ou créée.

Exemples d’usage :
Un papillon naturalisé identifié comme Papilio machaon : lié à l’autorité Papilio machaon (Linnaeus, 1758)
Un herbier contenant une fougère : lié à Pteridium aquilinum
Une fresque antique représentant un lion : liée à Panthera leo
Une fouille paléontologique ayant livré un fossile : lié à Ichthyosaurus communis
Une notice de photographie illustrant une coccinelle : liée à Coccinella septempunctata
Un film ethnographique montrant la préparation d’un remède à base d'armoise annuelle : lié à Artemisia annua

Les Noms scientifiques dans Flora ont la particularité d’être gérés comme un thésaurus hiérarchique. Cela permet de :

  • Représenter la hiérarchie taxonomique (ex. : Règne > Phylum > Classe > Ordre > Famille > Genre > Espèce)
  • Faciliter les recherches transversales : une recherche sur un taxon supérieur (ex. Felidae) récupère toutes les notices liées aux espèces inférieures (Panthera leo, Felis catus…)
  • Préserver la cohérence scientifique : noms validés et normalisés
  • Gérer les synonymes : ex. Brontosaurus redirigé vers Apatosaurus
  • Éviter les doublons et erreurs de typographie (Homo SapiensHomo sapiens)

Comment créer un nouveau Nom scientifique ?

Bonnes pratiques

  • Inclure le descripteur si connu, dans le champ dédié (ex. : Panthera leo Linnaeus, 1758).
  • Vérifier si le taxon existe déjà dans la base pour éviter les doublons.
  • Placer le nouveau terme au bon niveau hiérarchique dans le thésaurus (famille, genre, espèce, etc.).
  • Ne pas ajouter de nom vernaculaire : seule la forme latine du nom est admise ici.

Ajouter un nouveau terme

  1. Ouvrir le module Autorités, puis accéder à la table Noms scientifiques.
  2. Ouvrir la vue en arborescence (thésaurus hiérarchique).
  3. Se positionner sur le niveau hiérarchique souhaité (classe, ordre, famille, genre…).

Si le nom doit être créé à la racine, sélectionner le nom du thésaurus lui-même.

  1. Cliquer sur « Ajouter un terme » dans le panneau d’arborescence. 
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Ajout d'un terme dans le thésaurus

  1. Saisir le nom scientifique dans le champ prévu
  2. Valider : le terme est alors ajouté à l’arborescence mais n’est pas encore documenté.
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Saisie du terme

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Terme ajouté dans l'arborescence

Documenter la notice

  1. Cliquer sur le crayon de la notice

Ne pas utiliser le crayon du thésaurus, qui ne permet que de modifier le libellé du terme.

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Modifier la notice

  1. Choisir la grille de saisie adaptée
  2. Renseigner les champs disponibles

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Exemple de champs disponibles

  1. Enregistrer la notice une fois complète.

Aligner un Nom scientifique avec ITIS

Versions 4.5.21 et ultérieurs

Flora permet d’aligner un nom scientifique avec la source externe de référence taxonomique, qu'est la plateforme ITIS (Integrated Taxonomic Information System).

L'alignement avec ITIS nécessite un paramétrage spécifique de Flora.

  1. Sélectionner le nom scientifique concerné.
  2. Cliquer sur l’icône d’alignement externe
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Aligner un nom scientifique

  1. Choisir la source d’alignement : ITIS.
  2. Renseigner l’identifiant ITIS du taxon
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Renseigner la source et l'identifiant du taxon

  1. Cliquer sur Aligner.

Une fois l’alignement effectué :

  • Le lien vers ITIS s’ajoute automatiquement en bas de la notice du nom scientifique.
  • Il est reporté automatiquement dans les notices des biens (spécimens, objets naturalistes…) liés à ce taxon.
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Exemple d'une notice d'un nom scientifique aligné avec ITIS

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Exemple d'une notice bien dont le nom scientifique est aligné avec ITIS