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Version 8.1 par Joséphine Ducruet le 2025/07/07 15:07
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1 (% class="mark small" %)**Versions 3.5 et ultérieurs**
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3 |(% style="width:840px" %)(((
4 (((
5 = A quoi servent les autorités Noms scientifiques ? =
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7 Documenter de manière **centralisée et normalisée** tous les noms scientifiques associés aux collections, qu’il s’agisse :
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9 * de **noms d’espèces animales** (//Canis lupus//, //Panthera leo//…),
10 * de **noms de plantes ou champignons** (//Quercus robur//, //Amanita muscaria//…),
11 * de **noms fossiles** ou **périodes paléontologiques** (//Trilobita//, //Diplodocus//, //Jurassique supérieur//…),
12 * ou de **taxons supérieurs** (familles, genres, ordres : //Rosaceae//, //Coleoptera//, //Mammalia//…).
13 * ou de tout **organisme vivant ou disparu** identifié selon les règles de la nomenclature biologique.
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15 Les autorités **Noms scientifiques** concernent tout être vivant ou entité biologique ayant un lien direct ou indirect avec les collections, que ce lien soit :
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17 * **Descriptif ou classificatoire** : désignation d’un spécimen, d’un objet naturaliste ou d’un motif figuré (ex. : un insecte représenté dans une œuvre).
18 * **Collecte ou provenance** : taxon déterminé d’un échantillon collecté sur le terrain.
19 * **Représentatif** : nom d’espèce mentionné ou identifié dans un texte, une image, un film, un audio…
20 * **Culturel ou symbolique** : référence à un animal ou une plante dans une œuvre à valeur ethnographique ou religieuse.
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22 (% class="box infomessage" %)
23 (((
24 Dès qu’une **identification scientifique** est possible, ou qu’un taxon est **nommé, représenté ou étudié**, une autorité "Nom scientifique" peut (et doit) être utilisée ou créée.
25 )))
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27 >(% class="small" %)Exemples d’usage :
28 >(% class="small" %)Un papillon naturalisé identifié comme //Papilio machaon// : lié à l’autorité //Papilio machaon (Linnaeus, 1758)//
29 >(% class="small" %)Un herbier contenant une fougère : lié à //Pteridium aquilinum//
30 >(% class="small" %)Une fresque antique représentant un lion : liée à //Panthera leo//
31 >(% class="small" %)Une fouille paléontologique ayant livré un fossile : lié à //Ichthyosaurus communis//
32 >(% class="small" %)Une notice de photographie illustrant une coccinelle : liée à //Coccinella septempunctata//
33 >(% class="small" %)Un film ethnographique montrant la préparation d’un remède à base d'armoise annuelle : lié à //Artemisia annua//
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35 Les **Noms scientifiques** dans Flora ont la particularité d’être gérés comme un **thésaurus hiérarchique**. Cela permet de :
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38 (((
39 * **Représenter la hiérarchie taxonomique** (ex. : Règne > Phylum > Classe > Ordre > Famille > Genre > Espèce)
40 * **Faciliter les recherches transversales** : une recherche sur un taxon supérieur (ex. //Felidae//) récupère toutes les notices liées aux espèces inférieures (//Panthera leo//, //Felis catus//…)
41 * **Préserver la cohérence scientifique** : noms validés et normalisés
42 * **Gérer les synonymes** : ex. //Brontosaurus// redirigé vers //Apatosaurus//
43 * **Éviter les doublons** et erreurs de typographie (//Homo Sapiens// ≠ //Homo sapiens//)
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45 = Comment créer un nouveau Nom scientifique ? =
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47 (% class="box successmessage" %)
48 (((
49 **Bonnes pratiques**
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51 * **Inclure le descripteur** si connu, dans le champ dédié (ex. : //Panthera leo// **Linnaeus, 1758**).
52 * **Vérifier si le taxon existe déjà** dans la base pour éviter les doublons.
53 * **Placer le nouveau terme au bon niveau hiérarchique** dans le thésaurus (famille, genre, espèce, etc.).
54 * **Ne pas ajouter de nom vernaculaire** : seule la forme latine du nom est admise ici.
55 )))
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57 == Ajouter un nouveau terme ==
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59 1. Ouvrir le module **Autorités**, puis accéder à la table **Noms scientifiques**.
60 1. Ouvrir la **vue en arborescence** (thésaurus hiérarchique).
61 1. (((
62 Se positionner sur le **niveau hiérarchique souhaité** (classe, ordre, famille, genre…).
63 )))
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65 (% class="box infomessage" %)
66 (((
67 Si le nom doit être créé à la racine, **sélectionner le nom du thésaurus** lui-même.
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70 (% start="4" %)
71 1. Cliquer sur **« Ajouter un terme »** dans le panneau d’arborescence.
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73 [[Ajout d'un terme dans le thésaurus>>image:1751891366231-683.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
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76 (% start="5" %)
77 1. Saisir le **nom scientifique** dans le champ prévu
78 1. Valider : le terme est alors ajouté à l’arborescence mais **n’est pas encore documenté**.
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80 [[Saisie du terme>>image:1751891554646-463.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
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82 [[Terme ajouté dans l'arborescence>>image:1751891596047-185.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
83
84 == Documenter la notice ==
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86 1. Cliquer sur le **crayon de la notice**
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88 (% class="box warningmessage" %)
89 (((
90 N**e pas utiliser le crayon du thésaurus**, qui ne permet que de modifier le libellé du terme.
91 )))
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93 [[Modifier la notice>>image:1751891850305-788.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
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96 (% start="2" %)
97 1. Choisir la **grille de saisie adaptée**
98 1. (((
99 Renseigner les champs disponibles
100 )))
101
102 [[Exemple de champs disponibles>>image:1751891945732-416.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
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105 (% start="4" %)
106 1. **Enregistrer** la notice une fois complète.
107
108 = Aligner un Nom scientifique avec ITIS =
109
110 (% class="mark small" %)**Versions 4.5.21 et ultérieurs**
111 )))
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113 (((
114 Flora permet d’**aligner un nom scientifique avec la source externe** de référence taxonomique, qu'est la plateforme **ITIS** (Integrated Taxonomic Information System).
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116 (% class="box warningmessage" %)
117 (((
118 L'alignement avec ITIS nécessite un **paramétrage spécifique** de Flora.
119 )))
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121 1. **Sélectionner** le nom scientifique concerné.
122 1. Cliquer sur l’**icône d’alignement externe**
123
124 [[Aligner un nom scientifique>>image:1751892791778-582.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
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127 (% start="3" %)
128 1. Choisir la source d’alignement : **ITIS**.
129 1. Renseigner l’**identifiant ITIS du taxon**
130
131 [[Renseigner la source et l'identifiant du taxon>>image:1751892931804-833.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
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134 (% start="5" %)
135 1. Cliquer sur **Aligner**.
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137 Une fois l’alignement effectué :
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139 * Le lien vers ITIS s’ajoute automatiquement **en bas de la notice** du nom scientifique.
140 * Il est **reporté automatiquement dans les notices des biens** (spécimens, objets naturalistes…) liés à ce taxon.
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142 [[Exemple d'une notice d'un nom scientifique aligné avec ITIS>>image:1751893060250-711.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
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145 [[Exemple d'une notice bien dont le nom scientifique est aligné avec ITIS>>image:1751893153980-688.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]]
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149 )))|(% style="width:300px" %)(((
150 (% class="box" %)
151 (((
152 **Sommaire**
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154 {{toc depth="2" numbered="true"/}}
155 )))
156
157 (% class="box" %)
158 (((
159 **Aller plus loin**
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161 * [[Saisir une autorité>>url:http://46.105.158.203/xwiki/bin/view/1_Fonctionnalit%C3%A9s/5.C.%20Saisie/Saisir%20une%20autorit%C3%A9/]]
162 * Liste des champs d'une autorité Noms scientifiques
163 * [[Typologie des champs d'une grille de saisie>>url:http://46.105.158.203/xwiki/bin/view/1_Fonctionnalit%C3%A9s/5.C.%20Saisie/Les%20diff%C3%A9rents%20types%20de%20champs/]]
164 * [[Saisir dans un thésaurus>>url:http://46.105.158.203/xwiki/bin/view/1_Fonctionnalit%C3%A9s/5.C.%20Saisie/5.E.%20Thesaurus/]]
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167 (% class="box" %)
168 (((
169 **Icônes principales**
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171 * [[image:1751381864410-542.png]] : Ajouter un terme
172 * [[image:1751554433028-352.png]] : Modifier
173 * [[image:1751893659749-575.png||height="21" width="18"]] : Aligner avec ITIS
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