Code source wiki de Les autorités Noms scientifiques
Version 10.1 par Joséphine Ducruet le 2025/07/07 15:15
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| author | version | line-number | content |
|---|---|---|---|
| 1 | (% class="mark small" %)**Versions 3.5 et ultérieurs** | ||
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| 3 | |(% style="width:840px" %)((( | ||
| 4 | (% class="box" %) | ||
| 5 | ((( | ||
| 6 | Les autorités **Noms scientifiques** permettent de centraliser et structurer les désignations scientifiques associées aux collections : espèces animales ou végétales, fossiles ou minéraux.Elles servent à identifier précisément les spécimens, objets naturalistes ou éléments représentés dans les œuvres, en s’appuyant sur des référentiels scientifiques reconnus. Leur gestion sous forme de **thésaurus hiérarchique** permet de refléter la classification taxonomique ou systématique, d’optimiser les recherches, et d’éviter les doublons. | ||
| 7 | |||
| 8 | La création d’un nouveau lieu s’effectue depuis la table Noms scientifiques en passant par l’arborescence. | ||
| 9 | |||
| 10 | Il est possible de les aligner avec ITIS. | ||
| 11 | ))) | ||
| 12 | |||
| 13 | ((( | ||
| 14 | = A quoi servent les autorités Noms scientifiques ? = | ||
| 15 | |||
| 16 | Documenter de manière **centralisée et normalisée** tous les noms scientifiques associés aux collections, qu’il s’agisse : | ||
| 17 | |||
| 18 | * de **noms d’espèces animales** (//Canis lupus//, //Panthera leo//…), | ||
| 19 | * de **noms de plantes ou champignons** (//Quercus robur//, //Amanita muscaria//…), | ||
| 20 | * de **noms fossiles** ou **périodes paléontologiques** (//Trilobita//, //Diplodocus//, //Jurassique supérieur//…), | ||
| 21 | * ou de **taxons supérieurs** (familles, genres, ordres : //Rosaceae//, //Coleoptera//, //Mammalia//…). | ||
| 22 | * ou de tout **organisme vivant ou disparu** identifié selon les règles de la nomenclature biologique. | ||
| 23 | * ou de **minéraux ou espèces minéralogiques** (ex. : quartz, pyrite, malachite), | ||
| 24 | |||
| 25 | Les autorités **Noms scientifiques** concernent tout être vivant ou entité biologique ayant un lien direct ou indirect avec les collections, que ce lien soit : | ||
| 26 | |||
| 27 | * **Descriptif ou classificatoire** : désignation d’un spécimen, d’un objet naturaliste ou d’un motif figuré (ex. : un insecte représenté dans une œuvre). | ||
| 28 | * **Collecte ou provenance** : taxon déterminé d’un échantillon collecté sur le terrain. | ||
| 29 | * **Représentatif** : nom d’espèce mentionné ou identifié dans un texte, une image, un film, un audio… | ||
| 30 | * **Culturel ou symbolique** : référence à un animal ou une plante dans une œuvre à valeur ethnographique ou religieuse. | ||
| 31 | |||
| 32 | (% class="box infomessage" %) | ||
| 33 | ((( | ||
| 34 | Dès qu’une **identification scientifique** est possible, ou qu’un taxon est **nommé, représenté ou étudié**, une autorité "Nom scientifique" peut (et doit) être utilisée ou créée. | ||
| 35 | ))) | ||
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| 37 | >(% class="small" %)Exemples d’usage : | ||
| 38 | >(% class="small" %)Un papillon naturalisé identifié comme //Papilio machaon// : lié à l’autorité //Papilio machaon// | ||
| 39 | >(% class="small" %)Un herbier contenant une fougère : lié à //Pteridium aquilinum// | ||
| 40 | >(% class="small" %)Une fresque antique représentant un lion : liée à //Panthera leo// | ||
| 41 | >(% class="small" %)Une fouille paléontologique ayant livré un fossile : lié à //Ichthyosaurus communis// | ||
| 42 | >(% class="small" %)Une notice de photographie illustrant une coccinelle : liée à //Coccinella septempunctata// | ||
| 43 | >(% class="small" %)Un film ethnographique montrant la préparation d’un remède à base d'armoise annuelle : lié à //Artemisia annua// | ||
| 44 | |||
| 45 | Les **Noms scientifiques** dans Flora ont la particularité d’être gérés comme un **thésaurus hiérarchique**. Cela permet de : | ||
| 46 | ))) | ||
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| 48 | ((( | ||
| 49 | * **Représenter la hiérarchie taxonomique** (ex. : Règne > Phylum > Classe > Ordre > Famille > Genre > Espèce) | ||
| 50 | * **Faciliter les recherches transversales** : une recherche sur un taxon supérieur (ex. //Felidae//) récupère toutes les notices liées aux espèces inférieures (//Panthera leo//, //Felis catus//…) | ||
| 51 | * **Préserver la cohérence scientifique** : noms validés et normalisés | ||
| 52 | * **Gérer les synonymes** : ex. //Brontosaurus// redirigé vers //Apatosaurus// | ||
| 53 | * **Éviter les doublons** et erreurs de typographie (//Homo Sapiens// ≠ //Homo sapiens//) | ||
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| 55 | = Comment créer un nouveau Nom scientifique ? = | ||
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| 57 | (% class="box successmessage" %) | ||
| 58 | ((( | ||
| 59 | **Bonnes pratiques** | ||
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| 61 | * **Inclure le descripteur** si connu, dans le champ dédié (ex. : //Panthera leo// **Linnaeus, 1758**). | ||
| 62 | * **Vérifier si le taxon existe déjà** dans la base pour éviter les doublons. | ||
| 63 | * **Placer le nouveau terme au bon niveau hiérarchique** dans le thésaurus (famille, genre, espèce, etc.). | ||
| 64 | * **Ne pas ajouter de nom vernaculaire** : seule la forme latine du nom est admise ici. | ||
| 65 | ))) | ||
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| 67 | == Ajouter un nouveau terme == | ||
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| 69 | 1. Ouvrir le module **Autorités**, puis accéder à la table **Noms scientifiques**. | ||
| 70 | 1. Ouvrir la **vue en arborescence** (thésaurus hiérarchique). | ||
| 71 | 1. ((( | ||
| 72 | Se positionner sur le **niveau hiérarchique souhaité** (classe, ordre, famille, genre…). | ||
| 73 | ))) | ||
| 74 | |||
| 75 | (% class="box infomessage" %) | ||
| 76 | ((( | ||
| 77 | Si le nom doit être créé à la racine, **sélectionner le nom du thésaurus** lui-même. | ||
| 78 | ))) | ||
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| 80 | (% start="4" %) | ||
| 81 | 1. Cliquer sur **« Ajouter un terme »** dans le panneau d’arborescence. | ||
| 82 | |||
| 83 | [[Ajout d'un terme dans le thésaurus>>image:1751891366231-683.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
| 84 | |||
| 85 | |||
| 86 | (% start="5" %) | ||
| 87 | 1. Saisir le **nom scientifique** dans le champ prévu | ||
| 88 | 1. Valider : le terme est alors ajouté à l’arborescence mais **n’est pas encore documenté**. | ||
| 89 | |||
| 90 | [[Saisie du terme>>image:1751891554646-463.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
| 91 | |||
| 92 | [[Terme ajouté dans l'arborescence>>image:1751891596047-185.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
| 93 | |||
| 94 | == Documenter la notice == | ||
| 95 | |||
| 96 | 1. Cliquer sur le **crayon de la notice** | ||
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| 98 | (% class="box warningmessage" %) | ||
| 99 | ((( | ||
| 100 | N**e pas utiliser le crayon du thésaurus**, qui ne permet que de modifier le libellé du terme. | ||
| 101 | ))) | ||
| 102 | |||
| 103 | [[Modifier la notice>>image:1751891850305-788.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
| 104 | |||
| 105 | |||
| 106 | (% start="2" %) | ||
| 107 | 1. Choisir la **grille de saisie adaptée** | ||
| 108 | 1. ((( | ||
| 109 | Renseigner les champs disponibles | ||
| 110 | ))) | ||
| 111 | |||
| 112 | [[Exemple de champs disponibles>>image:1751891945732-416.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
| 113 | |||
| 114 | |||
| 115 | (% start="4" %) | ||
| 116 | 1. **Enregistrer** la notice une fois complète. | ||
| 117 | |||
| 118 | = Aligner un Nom scientifique avec ITIS = | ||
| 119 | |||
| 120 | (% class="mark small" %)**Versions 4.5.21 et ultérieurs** | ||
| 121 | ))) | ||
| 122 | |||
| 123 | ((( | ||
| 124 | Flora permet d’**aligner un nom scientifique avec la source externe** de référence taxonomique, qu'est la plateforme **ITIS** (Integrated Taxonomic Information System). | ||
| 125 | |||
| 126 | (% class="box warningmessage" %) | ||
| 127 | ((( | ||
| 128 | L'alignement avec ITIS nécessite un **paramétrage spécifique** de Flora. | ||
| 129 | ))) | ||
| 130 | |||
| 131 | 1. **Sélectionner** le nom scientifique concerné. | ||
| 132 | 1. Cliquer sur l’**icône d’alignement externe** | ||
| 133 | |||
| 134 | [[Aligner un nom scientifique>>image:1751892791778-582.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
| 135 | |||
| 136 | |||
| 137 | (% start="3" %) | ||
| 138 | 1. Choisir la source d’alignement : **ITIS**. | ||
| 139 | 1. Renseigner l’**identifiant ITIS du taxon** | ||
| 140 | |||
| 141 | [[Renseigner la source et l'identifiant du taxon>>image:1751892931804-833.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
| 142 | |||
| 143 | |||
| 144 | (% start="5" %) | ||
| 145 | 1. Cliquer sur **Aligner**. | ||
| 146 | |||
| 147 | Une fois l’alignement effectué : | ||
| 148 | |||
| 149 | * Le lien vers ITIS s’ajoute automatiquement **en bas de la notice** du nom scientifique. | ||
| 150 | * Il est **reporté automatiquement dans les notices des biens** (spécimens, objets naturalistes…) liés à ce taxon. | ||
| 151 | |||
| 152 | [[Exemple d'une notice d'un nom scientifique aligné avec ITIS>>image:1751893060250-711.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
| 153 | |||
| 154 | |||
| 155 | [[Exemple d'une notice bien dont le nom scientifique est aligné avec ITIS>>image:1751893153980-688.png||data-xwiki-image-style-alignment="center" data-xwiki-image-style-border="true"]] | ||
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| 159 | ))) | ||
| 160 | )))|(% style="width:300px" %)((( | ||
| 161 | (% class="box" %) | ||
| 162 | ((( | ||
| 163 | **Sommaire** | ||
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| 165 | {{toc depth="2" numbered="true"/}} | ||
| 166 | ))) | ||
| 167 | |||
| 168 | (% class="box" %) | ||
| 169 | ((( | ||
| 170 | **Aller plus loin** | ||
| 171 | |||
| 172 | * [[Saisir une autorité>>url:http://46.105.158.203/xwiki/bin/view/1_Fonctionnalit%C3%A9s/5.C.%20Saisie/Saisir%20une%20autorit%C3%A9/]] | ||
| 173 | * Liste des champs d'une autorité Noms scientifiques | ||
| 174 | * [[Typologie des champs d'une grille de saisie>>url:http://46.105.158.203/xwiki/bin/view/1_Fonctionnalit%C3%A9s/5.C.%20Saisie/Les%20diff%C3%A9rents%20types%20de%20champs/]] | ||
| 175 | * [[Saisir dans un thésaurus>>url:http://46.105.158.203/xwiki/bin/view/1_Fonctionnalit%C3%A9s/5.C.%20Saisie/5.E.%20Thesaurus/]] | ||
| 176 | ))) | ||
| 177 | |||
| 178 | (% class="box" %) | ||
| 179 | ((( | ||
| 180 | **Icônes principales** | ||
| 181 | |||
| 182 | * [[image:1751381864410-542.png]] : Ajouter un terme | ||
| 183 | * [[image:1751554433028-352.png]] : Modifier | ||
| 184 | * [[image:1751893659749-575.png||height="21" width="18"]] : Aligner avec ITIS | ||
| 185 | ))) | ||
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